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收到日期:2020 年 2 月 21 日;接受日期:2020 年 5 月 28 日;发布日期:2020 年 6 月 19 日 作者隶属关系:1 英国东英吉利大学生物科学学院,诺里奇研究园区,诺里奇,诺福克 NR4 7TJ,英国;2 英国斯特拉斯克莱德大学斯特拉斯克莱德药学和生物医学科学研究所,格拉斯哥大教堂街 161 号,G4 0RE,英国;3 英国兰开夏郡 Edge Hill 大学生物系,L39 4QP;4 英国诺里奇约翰英纳斯中心分子微生物学系,NR4 7UH。 *通讯作者:Thomas C. McLean,T.mclean@uea.ac.uk 关键词:ActinoBase;放线菌;抗生素;发展;方法学;微生物生态学;调节;特殊代谢物;链霉菌;共生。缩写:antiSMASH,抗生素和次级代谢物分析壳;ARTS,抗生素耐药性靶向搜索者;BCI,巴罗科罗拉多岛;BGC,生物合成基因簇;c-di-GMP,3',5'-环二鸟苷酸;ChIP-seq,染色质免疫沉淀测序;DSB,双链断裂;EHEC,肠出血性大肠杆菌;EPEC,肠致病性大肠杆菌;GMC,共同进化的地理马赛克理论;GNPS,全球天然产物社会分子网络;GPA,糖肽抗生素;GPA,糖肽抗生素;HMM,隐马尔可夫模型;ISBA,放线菌生物学国际研讨会;LEE,肠细胞消除位点;MAG,宏基因组组装基因组;NRPS,非核糖体肽合成酶; PKS,聚酮合酶;RiPP,核糖体合成和翻译后修饰肽;SNP,单核苷酸多态性;TCS,双组分系统;T3SS,III 型分泌系统;WGS,全基因组测序。† 这些作者对本作品的贡献相同 000944 © 2020 作者

放线菌研究进展:2019 年 ActinoBase 综述

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